# 安装blast
wget https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/ncbi-blast-2.11.0+-x64-linux.tar.gz
# 解压
tar -zxvf ncbi-blast-2.11.0+-x64-linux.tar.gz  # 解压文件 
echo 'PATH=$PATH:~/ncbi-blast-2.11.0+/' >> ~/.bashrc # 将路径加入到环境变量
source ~/.bashrc # 重新编译路径
# 还要安装一个ncbi-blast
sudo apt install ncbi-blast+-legacy

# 建库
formatdb -i scaffolds.fasta -p F -o F
# 比对
blastall -i query.fasta -d scaffolds.fasta -o G19.blast.out -p blastn
# -i：比对的序列文件
# -d：参考基因组库
# -o：输出文件
# -p：比对方式