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1. 格式转换
在genbank上下载的gb格式的文件如何转换成fasta?参考BioPerl指南 – 序列格式的转换 – 柳城 (liucheng.name)
而关于Bioperl的暗转则参考Can‘t locate Bio/SeqIO.pm in @INC问题极简解决_wyh0908的博客-CSDN博客,其中:
1 | cpan>install Bio::SeqIO |
2. 基因组数据
从JGI和Genbank上下载了61个基因组的数据,其中10个数据需要重新注释,剩下的是注释结果。
3. 软件安装问题
在服务器中使用命令安装的时候经常被提示需要root权限,然而我并没有,也拿不到,可以用这个网站的方法linux下无root权限使用yum安装的方法_君只见独不见的专栏-CSDN博客_yum需要root权限。